故事舞台是在机动战士高达中的一年战争终结后七年。战争结束后一部份吉恩公国军事势力并未降伏继续在各地与地球联邦军发生军事冲突，因此地球联邦军内部强力主张追杀吉恩残余份子的激进排他势力泰坦斯（Titans）结成。由于泰坦斯对宇宙住民的强硬血腥镇压的手段，反势力奥干A.E.U.G.(台湾翻译为奥干，港译为奥古)结成。故事的开始于宇宙世纪0087年（U.C. 0087），前半主要围绕奥干和泰坦斯两派系的对抗，中段吉恩残余份子上阿克西斯(港译为阿古捷斯)登场，与奥干、泰坦斯角力周周旋，展开激战。
传奇黑客为拯救人类被系统AI追杀身死，意外成为异界第一宗门的宗主，但为了应对宗内全是卧底的局面和随身而来的系统危机，陈宁只想低调的再观望看看。但如锥处囊中，纵使他冷面无双心系世人，也是万花丛中过，朵朵都沾身，最后在系统代理人姜雀的帮助下，陈宁王霸之躯一抖，敌我双方纳头便拜！世界隐秘争先恐后对他打开，最终破解灭世危机。
在熏风高中上学的纯朴少年小山田耕太，迎来了来到城市后的第一个暑假。 这也是和学园的园花、也是狐妖的源千鹤交往后的第一个夏天。 浑身洋溢着轻松感的日子——耕太和千鹤，还有伙伴们，接下来将会有怎样一番经历呢？
2012年日蚀的一天进行名为“魔宴（Shabbat）”仪式，从而诞生出魔物“魅影（Phantom）”肆虐。 本作主角操真晴人在此仪式中生还，如谜一般的白色魔法使把变身系统Wizard Driver交付给他并变身成为假面骑士Wizard。 从此踏入守护人类及与魔物战斗的命运。
故事发生在一个架空的世界之中，邪龙“达钢索德”的频繁现身令整个世界都陷入了危机，魔导士们挺身而出，想要将邪龙封印。锡洛（松冈祯丞 配音）的父母便是其中的两位，不幸的是，封印任务失败了，锡洛就此成为孤儿。这段悲惨的遭遇让锡洛更加坚定了继承双亲遗志的决心，在16岁那一年，他踏上旅途，目标只有一个，就是封印邪龙为父母报仇。 一路上，锡洛遇见了形形色色的伙伴们。身世成迷的单纯少女萨拉特（市道真央 配音）、身手矫健特立独行的盗贼艾琳（内田真礼 配音）、成熟稳重身体强壮的麒鲁（楠大典 配音），在这些伙伴们的帮助和支持之下，锡洛在不断的成长着。
