《陌生人6》的故事发生在未来的韩、中、日三国经济共同区域——大连。三国情报当局获知以大连为震中，5年内极有可能发生一场毁灭性的大地震，威胁到三国乃至整个亚洲的存亡。而唯一能阻止这场大地震的方法是在大连机场地下设置特殊装置，将能源排放到地壳之外。三国为此决定秘密进行工程。但有一股黑暗势力企图暗杀工程相关负责人、阻止工程、泄露秘密。于是，三国情报当局各派出2名要员，与这股黑暗势力展开斗争。
故事发生在马路须加女子学园之中，因为财团破产，学园即将面临倒闭的危机。坚强乐观不服输的樱花（宫脇咲良 饰）、吹奏乐部部长京八桥（横山由依 饰）和樱花旧日的同学如今的校友滑舌（儿玉遥 饰）等人决定挺身而出和学校共存亡。她们从清纯可人的女学生摇身一变成为了衣着华丽的女公关，成立了夜总会，想要通过夜总会的收入来支持学校的运转。 经过了天才夜总会制作人西园寺景虎（笕利夫 饰）的调教，夜总会“水族馆”正式开张，一个和学园生活完全不同的世界展现在了女孩们的面前。除了要面对各路难产的客人，女孩们需要对抗的还有其他夜总会发来的挑战。
