少年牧真人（山时聪真 配音）的母亲葬身火海后，他随父亲牧胜一（木村拓哉 配音）与继母夏子（木村佳乃 配音）组成新家庭。深陷悲伤的真人阴郁孤僻，难以融入新环境。一次意外，他跟随一只会说话的苍鹭（菅田将晖 配音）闯入废弃的神秘塔楼，却不料进入了奇幻的“亡灵世界”，开始了一场不可思议的冒险…… 影片片名致敬了小说家吉野源三郎在1937年发表的同名小说，但电影故事由宫崎骏原创。
初三学生住之江圭太（武内健 配音）是一个普通的少年，但是，从双胞胎姐妹住之江亚香（竹达彩奈 配音）和住之江理香（巽悠衣子 配音）介入他的命运开始，他将彻底的摆脱曾经平凡的生活。亚香擅长家务，是个容易害羞的女孩，优秀的成绩让她有了能够接近圭太的理由。理香和姐姐正好相反，有些笨手笨脚的她一沾酒精即醉，在体育方面却有着过人的实力。姐妹两人唯一的共同点，就是在表达感情方面意外的热情和大胆，常常令圭太不知所措。 一开始，姐妹两人的大胆举动常常让圭太感到头痛，但是，随着时间的流逝，理香和亚香的身上，都展现出了让圭太为之着迷的特质。同时，圭太正面临着一个严峻的问题，姐妹两人，他究竟该选择谁呢？
