故事承接《鬼灭之刃 柱训练篇》。
自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除，世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大，为此政府组成了新组织4C，秘密驱除Amazon化的人类。 其中，幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是，变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优，他第一次没有产生“想吃”的想，并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后，作为Sigma型而复活的Amazon。
Pocket Monster，简称为宝可梦Pokemon。 它们是这颗星球上的不可思议生物。 空中、海中、森林中、城镇中，世界各处都能见到它们的身影。 这是期望在宝可梦战斗中成为最强的少年小智，与梦想收服全部宝可梦的少年小豪的故事。 与小智的搭档“皮卡丘”与小豪的搭档“炎兔儿”等众多宝可梦们一起，前往无限延伸的宝可梦世界的冒险就要开始了。 朝着梦想与冒险的宝可梦世界Let's Go！
