圣杯是传说中可实现持有者一切愿望的宝物。而为了得到圣杯的仪式就被称为圣杯战争。 参加圣杯战争的7名由圣杯选出的魔术师被称为Master,与7名被称为Servant的使魔订定契约。他们是由圣杯选择的七位英灵,被分为七个职阶,以使魔的身份被召唤出来。能获得圣杯的只有一组,这7组人马各自为了成为最后的那一组而互相残杀。 卫宫切嗣的养子卫宫士郎,偶然地与servant中的剑士Saber(セイバー)订定契约,被卷入圣杯战争当中...
魔术师与英灵为夺取能如愿所偿的愿望机“圣杯”而展开圣杯战争。日本的第五次圣杯战争结束后的几年,在美国西部的城市雪原市被观测到有新的圣杯战争预兆,集结的魔术师与英灵…… 缺失的职阶,无法被选中的英灵,暗中涌动的国家,为战斗造起来的城市。