圣杯是传说中可实现持有者一切愿望的宝物。而为了得到圣杯的仪式就被称为圣杯战争。 参加圣杯战争的7名由圣杯选出的魔术师被称为Master，与7名被称为Servant的使魔订定契约。他们是由圣杯选择的七位英灵，被分为七个职阶，以使魔的身份被召唤出来。能获得圣杯的只有一组，这7组人马各自为了成为最后的那一组而互相残杀。 卫宫切嗣的养子卫宫士郎，偶然地与servant中的剑士Saber（セイバー）订定契约，被卷入圣杯战争当中...
2117年冬、公安局ビルに一台の暴走車両が突入する事件が発生。その運転手は青森にある潜在犯隔離施設〈サンクチュアリ〉の心理カウンセラー・夜坂泉だった。しかし取調べ直前に夜坂の即時送還が決定する。 監視官の霜月美佳は、執行官・宜野座伸元らとともに夜坂送還のため青森へ向かう。 そこで待っていたのは、〈偽りの楽園〉だった。
战国时期，老爷曾经像魔神一样活跃，但那个时代已经过去了。老爷已经彻底堕落，住在贫民窟里，过着穷困潦倒的生活。这时候他遇到了一只狗，并可怜这只奇怪的短腿动物，向它伸出了援助之手，但是……他的新家臣的调皮行为让他受到了各种各样的摆布！
《少年骇客：最终进化》的第二季，精彩延续，看我们的小英雄如何打败新的敌人。
