故事发生在夏亚引领吉翁公国军赢得一年战争的平行宇宙。这一历史转折点导致地球联邦与吉翁公国的势力格局剧变。在空中宇宙殖民卫星生活的女高中生天手让叶,与难民少女尼娅安相遇后被卷入非法MS决斗竞技“军团战”,她驾驶着神秘最新型MS“GQuuuuuuX(吉夸克斯)”投身其中,而被通缉的神秘MS“高达”驾驶员修司伊藤也出现在她们面前。自此,少女与少年的相遇,梦想就此交织,宇宙世纪开启了新的未来......
故事发生在以音乐为中心、次文化兴盛的涩谷,与能映射出人们内心“真正的心愿”的「世界」中。某天,一直用音乐给人们带去力量的虚拟歌手初音未来,发现自己的歌声无论怎样都无法传达出去……而一群在「世界」中追寻音乐梦想的少年少女们与初音未来相遇,共同寻找着可以让初音未来“将歌声传达出去”的方法。
“月读”是希望与梦想交会的虚拟空间,而舞台幕布将缓缓升起,见证几位少女在此谱写短暂却珍贵的相遇篇章。不久的未来……东京的 17 岁高中生酒寄彩叶过着非常忙碌的生活,努力在打工和学业之间寻找平衡。她的纾压方式是观看很有人气的月见八千代直播,八千代管理名为“月读”的线上虚拟空间。彩叶时常光顾月读,在那里可以体验不同的人生,自由挥洒创意。她就靠着支持八千代度过空闲时间,还会玩战斗游戏赚一点外快。有一天,在回家路上,彩叶发现一根电线杆闪耀着奇异光芒,没想到电线杆里竟然凭空冒出一个可爱的宝宝。彩叶没办法随手抛弃宝宝,只好把她抱回家,眼睁睁看着她迅速长成一个跟自己同龄的少女。“你是辉耀姬吗?”这是你绝对不曾看过的辉耀姬物语。
滂沱雨夜里,朔也目击母亲坠入暴涨溪水中、失去踪影,自己也意外落桥,跌进长达一年的昏迷。一觉醒来,世界翻了面貌,警察判定母亲选择「自由死」,AI技术全面颠覆人类社会,有人因此解脱,有人无所适从。朔也无法接受母亲撒手人寰,为了抚慰内心伤痛,决意在虚拟世界里重建其模型,也让母亲的密友彩花自此走进他的生命。然而为了理解真相,秘密无所遁形,母亲从未揭露的一面也曝了光⋯⋯