在都立杜鹃花台高中放学后的教室里,响裕太在笔记本上一遍又一遍的画着GRIDMAN。这个世界曾经被一个少女创造、又被破坏。拯救了那个少年的心的,是从异次元来的超级代理人GRIDMAN,少女制作了拥有心灵的怪兽,以及裕太他们。在和平的世界力生活的他们,日常生活随着一身声巨响开始崩溃。
司空震在地下城发现了机关兽并私下研究,武则天发现端倪并派上官婉儿私下调查,而尧天组织也有自己的打算……几股势力交织在一起,暗潮涌动。在最终爆发的共同危机面前,众人还是为了长安的安危,力排万难,合力解决了机关怪兽,长安城恢复了安宁。