名门木叶学院转入一个神秘的转校生漩涡鸣人，就此一段忍者们的校园生活展开了。
在那次事故之后，我妻由乃（村田知沙 配音）恢复了平常的生活。炎炎夏日，她所在的学校组织了海滨夏令营，在碧海蓝天之下，由乃和日野日向（松冈由贵 配音）、野野坂真央（由加奈 配音）、高坂王子（白石稔 配音）等好友快乐玩耍，享受着青春瞬间。然而在她心底，似乎依稀隐藏着对天野雪辉（富樫美铃 配音）的些许记忆。那一闪而过的片段，搅扰她的心神，以致无论如何也要弄清那名男孩的下落和踪迹。借着这份执念，她穿越层层时空，渐渐靠近时空之神Deus（若本规夫 配音）的所在地。下一位神的人选悬而未决，由乃的介入将会令事态如何发展？ 本片根据えすのサカエ的原作改编，为该系列动画的OAD版。
他们拥有梦想。 总有一天，飞向广阔天空的梦想。 知晓被玻璃遮盖的这片天空有多么遥远。 遥远的未来。 人类在荒废的大地上建设了移动要塞都市“种植园”，并讴歌着文明。 在那当中建造的驾驶员居住设施“米斯特汀”，通称“鸟笼”。 孩子们就住在那里。 对外面的世界一无所知。 对自由的天空一无所知。 他们被告知的使命，只有战斗而已。 敌人是一切都被谜团覆盖的巨大生命体“叫龙”。 为了对抗尚未见过的敌人，孩子们乘上被称为“FRANXX”的机器人。 他们坚信，乘坐其中，就是对自己存在的证明。 有一位曾被称作神童的少年。 代号016。名字是广。 但他现在却跌落谷底。 是不被人需要的存在。 如果没有乘上FRANXX，就如同不存在一样。 在这样的广面前，某天，一位被称作02的神秘少女出现了。 她的额头，长着两根艳丽的角。 “——找到了哦，我的DARLING”
家住千叶县的17岁普通高中生高坂京介（中村悠一 配音）有一个14岁的妹妹高坂桐乃（竹达彩奈 配音），可是，很长一段时间以来，这个外表可爱的妹妹和自己的关系并不密切，有时甚至可以用冷淡来形容。妹妹的身上究竟发生了怎样的事情呢？终于有一天，一个关于桐乃的秘密被京介发现了。 可爱 的妹妹居然是宅系的兄控？！虽然桐乃百般否认，但事实不容狡辩。随后，原本只在妹妹身边出没的千金大小姐槙岛沙织（生天目仁美 配音）和毒舌少女五更琉璃（花泽香菜 配音）也渐渐的围绕到了京介的身边来，她们都和妹妹一样，是秋叶原系的御宅族。因为是兄控而觉得分外苦闷的桐乃，究竟会和妹控的哥哥京介发展出一段怎样妙趣横生的关系呢？
