在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
桃濑成海（伊达朱里纱 配音）表面上看来只是一个平凡的办公室小姐，但实际上，她是一个重度腐女。在工作场所中，成海极力隐瞒着自己的真实属性，扮演成为一个毫无特色的普通人，但一回到家中，她会立刻转换人格，徜徉在BL的海洋之中。成海非常非常的害怕被人发现的这个秘密，却在一次偶然中被名叫二藤宏嵩（伊东健人 配音）的男人给撞了个正着，更糟的是，这个男人是她需要朝夕相处的同事。 实际上，二藤宏嵩也有着不为人知的一面，在工作中，他的办事效率极高，个性冷酷无情，但生活里，他是一个重度沉迷于游戏之中的宅男。当宅男遇见腐女，会产生怎样有趣的化学反应呢？
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」，被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后，恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
许多年前，宇宙最大魔王弗利萨（中尾隆圣 配音）接连败在超级赛亚人之手，他的残党欲孽则流浪宇宙之中寻找那美克星人的新定居点，以期将弗利萨再度复活。几经周折，军队代理索尔贝（斋藤志郎 配音）利用地球的龙珠把弗利萨带回人间，而这个刚刚复活不久的魔王很快展开了他的复仇计划。半年之后，浩浩荡荡的弗利萨大军降临地球，悟饭（野泽雅子 配音）、比克大魔王（古川登志夫 配音）、克林、天津饭、武天老师挺身而出，而孙悟空（野泽雅子 配音）和贝吉塔（堀川亮 配音）则正跟随维斯（森田成一 配音）在遥远的宇宙深处接受试炼。 危机时刻，地球被入侵的消息终于传到维斯和比鲁斯那里，悟空、贝吉塔即将与他们宿命中的冤家再度展开对决……
高二的不良少年佐佐木与高一的腐男子宫野，坚决不走BL路线的男子高校日常生活（Boys Life），因为一起校内的纠纷促使两人结缘，之后两人的关系变得越发微妙......
