单行本第4卷同捆OAD
全人类被神奇的现象一瞬间石化后过了几千年——拥有超人般头脑、天生的科学少年·千空苏醒了。 在文明遭到毁灭的石头世界里，千空集结新伙伴的力量一起建立“科学王国”，最终目标是用科学的力量复原整个世界。但是，由灵长类最强的高中生狮子王司领导的“武装帝国”却步步为营。旨在净化人类的司试图通过使用强大的力量来阻止科学的发展。 科学 vs 武力的战斗经过激战，千空等人的科学王国占优势，之后两国终于和解。 由于同伴的谋反而处于冷休眠状态的司为了复活全人类，科学王国以石化光线的发生源、地球的背面·新世界作为目标！ 冲出世界解开石化之谜！石头世界大航海时代终于开幕——‼
铃木园子的叔叔次郎吉不甘心失败，决定再次向怪盗基德发出挑战。这位坏脾气的大叔斥巨资制造了巨型的飞船贝尔·雪利二世号，并以镶嵌有名贵宝石“天空的贵妇人”的戒指作赌注，邀请基德前来挑战，看他能否在东京到大阪的这6小时时间内完成这项困难的任务。柯南、小兰等人理所当然也接到邀请，甚至电视台的人也兴师动众前来。随着时间的流逝，双方的对决悄悄展开。另一方面，恐怖组织红色暹罗猫也登上了飞船。此前不久，红色暹罗猫袭击了国立东京微生物研究所，并盗走一种致命的病毒。 本片根据青山刚昌的同名漫画改编，是该动画的第14部剧场版。
主角·麻生胜是望月博士的助手，由于望月博士正在研制NEO生命体·ZO，麻生胜不幸成为了NEO生命体的实验品，望月博士将蟥虫的因子注入了麻生胜体内！之后麻生胜逃离了研究所，由于不能接受自己的身体所以一直沉睡在深山…… 一天，他突然感觉到望月博士的感应而醒了，原来博士他以改造了一只NEO生命体·杜拉斯，杜拉斯有着比ZO更强大的力量，而且拥有用自己身体的一部分来制作怪人的能力！ 另一方面，杜拉斯正准备捉拿望月博士的儿子·望月宏，皆因博士对宏的爱多于自己，从而使杜拉斯嫉妒不已。但幸运的是，ZO正好出现，并救了宏，与NEO生命体·杜拉斯的连翻激斗也由此开始！
故事讲述男主角大山武进入了原本是女校的大日学园，在这间女性的花园的学校里，等着大山武的是能干的青梅竹马兼学生会副会长的女主角天谷春恋、高傲的大小姐姫神木灵及非常可爱的未婚妻栉八稻穗。
