在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
一半是人，一半是猩猩的新英雄！ 猩猩人和恐怖分子展開激烈衝突！！ 恐怖組織「動物解放同盟（ALA）」攻擊生物科學研究所時， 救了懷孕的黑猩猩，這隻黑猩猩產下了半人半猩猩的「猩猩人」查理。 15年後，查理在人類雙親的扶養下，進入高中就讀，認識了人類女孩露西。 另一方面，ALA的所作所為越來越激烈，甚至計畫要查理加入他們！
高中生熏和奈奈从小就是青梅竹马，熏就连做梦都一直妄想着和奈奈做SM的事情。也许这就是命运的捉弄，某一天奈奈居然真穿上了（啪~~~）站在了熏得面前。多年来的梦想居然成了现实，致使熏的S魂正式觉醒。于是，两个人不可告人的秘密故事就这样展开了。
阿良良木历（神谷浩史 配音）正在为了即将到来的考试进行着刻苦的准备，一次偶然中，阿历发现镜子里竟然映不出自己的身影，惊慌失措的他找到了专门研究不思议事件的斧乃木余接（早见沙织 配音）和影缝余弦（白石凉子 配音），让阿历没有想到的是，两人竟然告诉他，他即将要变成吸血鬼了。 某日，一股邪恶的势力出现，阿历的两个妹妹火怜（喜多村英梨 配音）和月火（井口裕香 配音）遭到了绑架，同时失踪的还有独臂少女神原骏河（泽城美雪 配音），目的只有一个，那就是逼迫阿历就范。就这样，阿历和余接一起踏上了救援的旅途，最终，他能否抵抗命运，并且救回生命中重要的人们呢？
