《东京食尸鬼第三季》混杂于群众之中,以人类的肉为食。拥有人类的形态,却与人类不同的存在……“喰种”。对“喰种”进行驱逐、研究的CCG,为了达成某个命题,而新设了实验体集团。 ——其名为“Quinx”。并非“正经人类”的他们,与佐佐木琲世一等搜查官一起在“东京”面对的事物究竟是——!?
魔法使芙莉莲与勇者辛美尔等人在长达10年的冒险中打败了魔王,给世界带来了和平。作为一个活了一千多年的精灵,芙莉莲约定将与辛美尔等人再会,自己则先独自旅行。五十年后,芙莉莲拜访了辛美尔,但辛美尔已经老了,生命已所剩无几。之后,芙莉莲目睹了辛美尔的死亡,她也猛地意识到自己从未“了解人类,并后悔不已,因此她踏上了为了了解人类而进行的旅途。在那段旅途中,她遇见了各种各样的人,经历了各种各样的事……