光盟与影盟战火因“捍世号”暂歇，影盟迅星移为寻和平偶像卷入黑帮火拼，意外获上古星盘后瘫痪。遭觊觎者围攻时被光盟卧底带往光辉地区，发现“捍世号”后得叱风云授武器之法。百万王遇刺后，叱风云遭围攻击退敌人，命迅星移寻上古武器持有者，其失踪老师现身欲揭颠覆秘密。
因为希望引起美丽女孩赤木晴子的注意，曾经的不良少年樱木花道加入湘北篮球队，展开了全新的青春人生。在与陵南的艰苦对决过后，樱木迎来了人生的第二场比赛，对手是女生人数超过70%的武园学园高等学校，因为男生少，武园篮球部的男生分外努力，而他们的女子啦啦队也格外热情高涨，因此武园篮球部可谓实力和人气兼备的超级对手。在比赛前，樱木重逢初中时代表白后曾拒绝他的女孩叶子，叶子爱慕武园的9号球员小田，他们和樱木出自同一学校。小田视篮球如生命，他坚决反感樱木这样的坏小子进入球场。旧日同窗重逢，交织着各样情感的比赛由此展开…… 本片根据井上雄彦的同名漫画改编，为该动画的第一部剧场版。
动画舞台设定在1999年、14岁的明智安娜从2027年穿越回1999年的真未来市、在那里她结识了同为14岁、憧憬成为名侦探的少女小林未来、两人目睹了幻影怪盗团夺走人们珍贵之物、令众人陷入困扰的情景后决定挺身而出，变身为名侦探光之美少女。
在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。 另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化…… 与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——。
