趁着高中入学之机，开始了单身生活的主人公夏目智春。他是那种一眼看上去就觉得普通到没什么特色的高中生。但是呢，还是稍微有点和其他人不同之处。那就是，被青梅竹马的少女・水无神操绪的幽灵附体的事——。 搬到了新的住所“鸣樱邸”，打算享受轻松快乐生活的智春。然而，他的愿望却被彻底击破了——一位叫作黑崎朱浬的美女受哥哥所托前来交托一个手提箱，却被以巫女打扮登场的少女嵩月奏前来抢夺…… 而更重要的是，得到这个手提箱的人，有着去追寻“世界隐藏之真实”的责任。
4000年前，出逃王宫的商朝王孙有莘不破救下太一宗弟子江离，两人结伴游荡荒原，入商队、遭异兽、遇天劫，属于少年的冒险正在展开。在他们的身后，王朝交替、山雨欲来，夏商之间爆发了一场有史以来最伟大的战争。命运的齿轮开始转动，那些天赋异禀的少年，早已身在局中。
水门都市普利斯特拉一战中，昴一行艰难取得了胜利，但代价却过于沉重。由于"暴食"的权能，蕾姆陷入沉睡，库珥修失去了记忆，而尤里乌斯则被夺走了名字。 在寻找拯救他们的线索的过程中，昴得知了那位据说能看透一切、拥有所有知识的"贤者"夏乌拉的存在。 下一个目的地便是贤者居住的"昴宿星团观测塔"——那是矗立在就连最强的"剑圣"莱因哈特都未能征服的大沙漠"奥古利亚沙丘"深处的、位于世界尽头的巨塔。 肆虐的自然灾害、未知的魔兽，以及超乎想象的威胁，重重险阻横亘在前。为了与同伴一起，夺回失去的一切，少年赌上性命的旅程就此拉开序幕——
精灵宝可梦，简称宝可梦， 这颗星球上非常非常不可思议的生物， 在天空、大海、森林、街道之中到处都能看到它们的身影。 持有不可思议吊坠的来自帕底亚的少女——莉可。 持有神秘精灵球的来自关都的少年——罗伊。 以广阔的宝可梦世界为舞台， 莉可和罗伊的新冒险开始了！ 等待两人的相遇，还有命运是—！？ 这是一个通过冒险“找到”重要的东西的故事。
