超级人工智能“智体”即将引爆全球核弹危机，把世界推向毁灭边缘。而伊森·亨特（汤姆·克鲁斯 饰）和他的IMF小队在上次行动中遭遇重创，团队濒临分崩离析。虽然伊森已获得关闭“智体”的钥匙，但要彻底消灭“智体”，完成这一拯救全人类的终极任务，仍需要IMF小队齐心协力突破重重困难。他们不仅要面对全知全能又无影无形的“智体”与其手下盖布瑞尔（埃塞·莫拉雷斯 饰）的百般阻拦，还要解决来自过去的种种恩怨。每个抉择都关乎信念与命运，等待伊森和IMF小队的，究竟是怎样的结局？
《恐怖的二楼》少年畑野龙（铃木福 饰）似乎天生具有灵视的能力，他和外婆、妈妈（YOU 饰）搬到新家，结果发现他们不是这里的唯一住户。小龙看见了女鬼，可是妈妈却不相信；《X医院》信心受挫的实习医生佐佐木直树（藤谷太辅 饰）倍感压力，在此期间，各种诡异事件也交替在他身边出现，令他疲于奔命；《影子的暗示》厌倦了枯燥的工作，远山美和（深田恭子 饰）计划转职旅游公司，期间她时常会看见神秘黑影，而黑影所至之处必然发生灾难；《女子高中大危机》在女子高中任教的泽木洋介（坂口宪二 饰），其班上名叫亚里沙的女孩似乎制作了一个地下网站，他没有料到，恐怖的危机正慢慢降临这所高中；《蠕动的人偶》园田里菜（指原莉乃 饰）在街上相中了一个士兵人偶，于是不假思索将其买了下来，谁知这个仿佛有生命的玩偶正渐渐影响她的生活。
