物語は新たなステージへ──『POP IN ２』のリリースから半年。ＭＥＭちょの尽力の甲斐もあり、今やB小町はブレイク寸前。アクアはマルチタレント、あかねは実力派女優の道を順調に歩んでいる。一方で、かなは以前の明るさを失っていた。そして、アイとゴローの死の真相を追い求め、ルビーは芸能界を駆け上がる。────嘘を、武器にして。
大门大意外地遇到了亚古兽，两人见面就大打出手，亚古兽战败后称大门大 为大哥，但是数码特搜部队（DATS）不容许未受其队员管理的数码兽留存在这个世界上，必需送回数码世界，而后汤岛告诉大若加入DATS他就可以跟数码世界的强敌战斗，大因此加入DATS，与淑乃及托玛组成小组，一同解决数码事件。 托玛发现日本的数码事件频率增加并非偶然，因此请假回到欧洲调查，发现根源来自于人类的七宗罪。而比丘兽的事情让大他们知道了其幕后黑手是究极体数码兽——墨丘利兽搞的鬼，也因此决定动身前往数码世界。而在数码世界，他们见到了一个人类小孩——郁人，他自称数码兽，对人类怀有怨恨。 历经艰难以后和汤岛老人会合并见到了墨丘利兽，墨丘利兽指责人类没有遵守约定，严重干扰了数码世界的秩序，对数码兽实施残酷的杀戮，然而汤岛却一再强调人类什么事情都没有做。最后谈判破裂，汤岛一面努力制造混乱局面，一面把大一行人送回了人类世界 ，自己却留在了数码世界。回到人类世界的大家决定去见见郁人的父母。 在见到郁人的父母后，郁人拒绝承认自己人类的身份，在大的开导下，他才准备融入这个家庭，并希望回到数码世界，跟墨丘利兽告别。然而等待他们的，却是墨丘利兽的死亡，而杀死它的，就是曾经和大的父亲，郁人的父母以及汤岛、萨摩一同前往过数码世界的仓田。最后，大门大为DATS中唯一一位留在数码世界者
海神岛的世子金自幼便遭受了极大的变故，导致他无法化神成鲲，更无法继承海神之位。然而当危难来临，他毅然踏上了解救海神岛之路，并且从中学会了责任与担当。
晨曦微茫的小岛上，海水轻柔俯视着纤尘不染的沙滩。伴随着浪花的涌动，浮游生物、海藻、海螺、扇贝等海洋生命搁浅在陆地之上，等待它们的则是饥肠辘辘的捕食者。矶鹬（sandpiper）三五成群，鸣叫着落在了湿漉漉的沙滩上，啄食着可口的扇贝。许是经过了多年的历练，每当新一波潮水涌过来时，它们便第一时间轻盈地躲开，绝不会沾湿半根羽毛。不远处的灌木丛里，一只破壳未久的小矶鹬窥伺着父母的一举一动。少顷，妈妈飞回巢穴，小家伙一如既往张开嘴巴等着喂食，不过妈妈似乎决意要让孩子独立，自顾自将扇贝肉吃到肚子里。没有办法，小矶鹬只能走向海边。然而海水是那么讨厌，一波一波扑向这个未谙世事的小家伙。这时，一个意外突然发生…… 本片为《海底总动员2》的贴片动画。
