令和末期,日本因全球核战影响走向衰败,大量难民涌入,更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生,引发民众暴动,国家体制崩溃,人口锐减至原来的十分之一以下,文明水平倒退至明治初期,并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后,大和历56年,生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台,一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
南光太郎和秋月信彦在一个日食的日子出生、并且以兄弟的身份被扶养长大。信彦的父亲,秋月总一郎是秘密组织戈鲁戈姆的成员之一。在光太郎和信彦19岁生日那天,两人被这个秘密组织捉去改造成为戈鲁戈姆的支配者·创世王的候补者·世纪王。世纪王·黑日必须和世纪王·影月进行赌上性命的战斗,胜者就可以成为新一任的世纪王。但是被改造成为黑日的光太郎在秋月总一郎的帮助下,成功在脑改造手术前逃脱出来。此后光太郎成为假面骑士Black,为了保护日本,救出信彦而与戈鲁戈姆对抗。但是信彦却在被救出之前就变成世纪王·影月,于是光太郎不得不与他唯一的亲友信彦进行宿命的战斗。