《东京食尸鬼第三季》混杂于群众之中,以人类的肉为食。拥有人类的形态,却与人类不同的存在……“喰种”。对“喰种”进行驱逐、研究的CCG,为了达成某个命题,而新设了实验体集团。 ——其名为“Quinx”。并非“正经人类”的他们,与佐佐木琲世一等搜查官一起在“东京”面对的事物究竟是——!?
日本各地出现了异空间「魔都」── 由于只有女性能从魔都的「桃」得到特异的能力, 因此便由女兵组成了「魔防队」。 某一天, 过着抑郁生活的男高中生──和仓优希 不小心闯进了突发性产生的魔都入口, 在那里,遇到了「魔防队」第七组的美丽队长──羽前京香, 而她竟向优希宣言:「我要你当我的奴隶。」