邪电王国的希拉博士因为妒忌人类的超文明,于是向地球进行连串破坏行动。久保田博士下令健太、耕一祈、瞬、千里和杏子变身成电磁战队百万连者,进行对抗邪电的行动。其后,更出现了第六位战士早川裕作,起初新战士不太喜欢电磁战队,后来相处日子越多,感情越深厚。希拉更控制王者魔兽,打算与电磁战队同归于尽。
2050年,太平洋深处孤岛的猩红别墅里,一群失忆女孩被圈养,唯有编号12的安晓尚存一丝本能。一次意外,她在储藏室撞见尸骸,唤醒了对自由的渴望,与执念寻找失踪姐姐(编号07)的林溪结成同盟。别墅主人莉娜被医生李鸣精神控制,以“被选中”为诱饵,推行末位淘汰规则。夜间“吸氧”实为记忆唤醒药物,安晓频繁梦见过往。编号5的女孩被带走时,甩出一枚鸢尾发夹,林溪认出是姐姐同款,探寻决心更甚。安晓自伤求医时,发现李鸣处有与自己相似的女孩照片,身世成谜。二人潜入储藏室,揭开“活体供体”真相——女孩们的激素被卖给富豪,林溪姐姐已因激素衰竭被“处理”。理念分歧让二人决裂,林溪独自刺杀莉娜,却得知安晓是莉娜的女儿,也是李鸣培育的“完美供体”。殊死搏斗中,林溪护安晓被麻醉,莉娜奋力护女,安晓恢复记忆后彻底反抗,这群女孩终在守护与救赎中破茧重生。