自世界各地出现连接异次元与现实世界的通路「传送门」,已过了十多年。觉醒了特殊能力,被称为「猎人」的人们,与存在于传送门里地下城内的魔兽不断厮杀。猎人的能力在觉醒后就不再有成长空间,其等级也不会再有变化。然而,被称作是人类最弱兵器的程肖宇,在一次双重地下城的突击任务中得到了只有自己能够「升级」的能力,得以在战斗中不断变强。顺利通过转职任务,得到能操纵暗影士兵的职业「暗影君主」的肖宇,为了取得或许能医治母亲病情的道具「生命神水」的素材,而投身于新的战斗之中。
女高中生铃木的个性开朗、交友甚广、擅长察言观色,是班上的中心人物之一,她喜欢的对象是坐在自己隔壁的男同学谷,而谷的个性与铃木恰恰相反,他内敛沉稳、有主见、待人一视同仁。铃木一直无法鼓起勇气告白,直到某日一个偶然机会,两人放学回家时走在同一条路上,并因此牵起了手。之后两人相互倾诉对彼此的好感,并开始交往,而同学们虽然感到讶异,但也都很支持两人的恋情。
幼年汤直与龙女的一次偶遇,意外开启了他的“天眼”——从此,他能看见往来人间的神仙与精怪。这双独一无二的眼睛,将他引入了一个与凡俗并行的世界。在那些难忘的经历中,汤直结识了形形色色的朋友,也在一次次看似寻常却暗藏奇妙的日常里,体会到欢笑与温情。一位平凡书生,与一群性情各异的神仙精怪,在人间烟火中相遇相伴——这个关于奇遇、友情与成长的故事,正徐徐展开。
《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历,人类正式开始进出宇宙2世纪,但因为2次大型陨石的坠下,人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年,第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面。地球连邦政府经过调查,发现是由人类未知的技术制造的物体,这种地球以外的技术被称为EOT(Extra over technology)。地球连邦政府组成了“EOT特别审议会”和“EOTI机关”进行调查。然后EOTI机关的代表比安博士发表了研究结果,表示地球有被宇宙以外的生命体侵略的危机。从此,人型机动兵器:Personal Trooper的研究开始了。