在《纳米核心》的里世界中，各位主角配角以及龙套们，都要在“纳米学院”中学习生活。大家在这个世界不那么认真地上课、考试、过着奇奇怪怪的校园日常，并不正经地保护着这个世界，以及不停地用各自的方式向大家“表示友好”。
操纵异形之力的吸血鬼侦探阿尔涅·尼塔特。热爱吸血鬼的名门贵族千金琳·莱茵维斯。本应生活在永无交错的世界中的二人，为解开被血染的谜题而联手。被黑夜笼罩的穷途末路之际，琳迷失在异形者居住的迷之街道·吕根贝尔格。在那里与被称作“最强”吸血鬼阿尔涅的相遇，使少女所生活的世界发生了翻天覆覆地的变化。诡谲怪诞的事件簿，开幕——
