自从人类的和平与幻想被超大型巨人打破的那天起,艾伦·耶格尔便每天持续着没有尽头的战斗。因为眼睁睁地看着无力抵抗的母亲被巨人吃掉,艾伦发誓要将世间的巨人一只不留地驱逐出去。但是,在严酷的战斗中,艾伦自己也变成了巨人。为了人类的自由,艾伦施展着巨人的力量,并在希娜之墙的史托黑斯区和女巨人发生了激烈的冲突。在这场巨人间的战斗中,艾伦最终胜出了。即便如此,艾伦以及人类的休息时刻也不会到来。下一轮的战斗已经宣告开始。对于逼近罗塞之墙的巨人大群,人类将如何面对?
在都市内出现了连续女性被杀事件。经警察调察,犯案者是异形怪物,而主角·风祭真因为一直发着相关事件的梦而备受困扰…… 风祭真的父亲是遗传学研究所里的科学家。而真则自愿成为了研制不治之病的实验品,但却被疯狂的科学家·鬼塚实行的现阶段最危险的生化实验·Lv3的遗传因子操作实验而变成了生化战士:真·假面骑士。但鬼塚最大的目的就是要将真供幕后BOSS·“财团”作为军事武器。真最后逃出了『财团』的魔掌,并且与“财团”的超级改造战士·豪岛展开生死战!