第二季的故事发生在第一季结束八年后，军情六处的特工乔纳森·派恩（汤姆·希德勒斯顿 饰）以为自己彻底埋葬了过去，如今他的化名叫作亚历克斯·古德温，在伦敦负责主导一个秘密监视小组，生活平静安逸。然而某晚，他偶然瞥见一位过去受雇于理查德的佣兵，并促使他再次行动，与哥伦比亚商人泰迪·多斯·桑托斯（迭戈·卡尔瓦 饰）发生冲突。在这段危机四伏的新旅程中，派恩结识女商人罗克萨娜·博拉诺斯（卡米拉·莫罗 饰），她勉为其难帮助派恩潜入泰迪在哥伦比亚的军火行动。抵达哥伦比亚后，派恩深陷一场涉及武器和游击队训练的致命阴谋。随着敌我局势愈加难分难解，派恩急迫揭露一场旨在扰乱国家安宁的阴谋，但背叛如影随形，他必须决定自己究竟需要赢得谁的信任，以及在为时已晚之前，自己愿意付出多大的代价。
周大伟和小老婆叶艳凤（柳影虹 饰）收养了一名女婴，取名小红（陈松伶 饰）。然而，这一决定导致了周家的经济状况逐渐下滑。在艰难的岁月里，小红艰难成长。成年后，她有幸加入了明月社剧团，开始了她的歌唱生涯，并改艺名为周璇。在一次歌唱比赛中，她展现出了非凡的才华，开始崭露头角。 尽管璇受到了团员缘萍（何嘉丽 饰）的敌视，但她得到了严子华（黎明 饰）和张雪文（马海伦 饰）的支持和爱护。子华与周璇之间渐生情愫，经历了一系列波折后，最终他们结为夫妇。然而，周璇的契爷楼建中却只把她视为摇钱树，导致与子华之间频频发生冲突。建中设下奸计破坏了他们之间的感情，最终导致了子华和周璇的离异。周璇受到了巨大的打击，但在此时，她遇到了布匹行的少东罗浩德。罗浩德对周璇关怀备至，令她再次陷入情网中。
清嘉庆帝在位四年有心勤政，无奈太上皇乾隆诸多干涉，新政难展。奸臣和珅知悉乾隆病危，巧计讹乾隆立下免死敕旨，广结群党，欲篡位自尊。嘉庆四面受敌，不由得想起既敬且畏的二兄永硕。喜爱摔跤，饮酒，好管闲事，四处云游的他，此时不知身在何方？其实乾隆十分喜爱永硕，曾有意将他立为皇储。但他不愿当皇帝，把皇位让给了弟弟嘉庆。乾隆很想看到永硕娶妻，嘉庆贴出皇榜为二哥招亲，闹得京城沸腾。此事引起一位神秘蒙面人的关注。
