前作的结尾中，以背对镜头、马尾辫的身影登场预告的速水，此次终于正式参战。在第二季中，以速水所属的关东最大极道组织“无双山一家”为中心，牵连上洛毛等“离散之月”，以及宿敌野江谷率领的“月晕组”，两方的对立从北九州扩大到席卷全日本的大规模抗争。与警方的对立愈发激化，甚至连神秘组织也开始暗中行动，事态发展成连死者不断出现的地狱般景象。无论是格斗场面还是枪战动作等，一切都全面升级，更加激烈的抗争场面亦是本作的看点之一。
刑警徐靖之（段奕宏 饰）因故人案中的疑点陷入心结，自请离队深造，十年后自认放下心结的他重归一线，回到前妻何雅（王佳佳 饰）带领的刑一队。然而新案环环相扣，古怪难查，徐靖之发觉诸案的幕后黑手庄明诚（窦骁 饰）竟是“已死”的故人之子，“弟弟”陆染。徐靖之将计就计，一边凭借领导战友的信任打入犯罪集团内部，一边接近庄明诚，阻止他泥足深陷。殊途兄弟借案交锋，两人终将作出各自的抉择。
社会不断进步，生活日渐富裕，但当物质让我们感到如此富足之际，人与人之间的距离却原来越远。而在当下这个飞速发展的时代，很多人的困难却被有意无意忽略。美丽善良的里见凉（深田恭子 饰）是东京下町一所民间地区福利组织——社会福祉协议会的职员，童年一段刻骨铭心的经历，让她发誓再也不放开任何乞求帮助之人的手。入职以后，她时常不顾个人安危，为管辖区内的人们全力奔走。但即便如此，因为制度漏洞和部分从业人员的责任心稀缺，还是有很多人求告无门。 即便前方困难重重，里见凉从来没有放弃前进的脚步。她的爱心感染了同侪，也感动了社区内每一个平凡的人……
1942年3月19日傍晚，一架载有笃信者的盟军飞机飞抵仰光机场，降落之时发现机场已被日军占领，奋起复飞，不料第二天最高当局却收到了飞机被击落的AAAA级电报，引起了当局极大恐慌，笃信者此次的使命是向中国战区最高当局送达一份绝密的行动方案及联络密码，当局命令军事情报部门不惜一切代价，查到失踪飞机和笃信者的下落。 笃信者此次携带的是此次轰炸东京的全部绝密计划，与太平洋上的航母编队以及与执行轰炸任务的轰炸机编队的联系密码，一旦这份文件落入日军手中，不但轰炸东京计划将失败，还会使得整个护送舰队沦为日军嘴里的待宰羔羊！ 笃信者受伤跳伞，降落到了日军海军第六航空基地驻守的三灶岛，被当地岛民营救并藏匿。日军对岛屿实施了严密的封锁，派人上岛营救几乎是天方夜谭。面对这个不可能完成的任务，军事情报部门不得不启动了一支长期静默的情报组，唤醒了驻扎日本的情报员伐木工----
