夜神月设计除掉了女友和跟踪自己的FBI的探员，趁机混进了调查本部，但是，L对他的怀疑并没有结束，新一轮的智力游戏继续进行。月和L的头脑对峙迎来了新的局面。借着“帮助ICPO逮捕Killer”的理由，月潜入了调查本部。这样月就和对月虎视眈眈的L直接面对面的交锋了。
但是，发生了月预想以外的事件，与死神硫克个性迥异的另一位死神雷姆也把自己的死亡笔记丢在了地球上，被一位崇拜Killer的小姑娘弥海砂捡到了。弥海砂主动和夜神月联系，答应协助他除掉L，条件是让月做自己的男朋友。弥海砂用自己一半的生命作代价取得了夜神月所没有的特殊能力“死神之眼”，这个能力可以直接看到对方的时候就能知道对方的真名，是对付L的最强武器，所以月同意了和小姑娘合作。但是就在弥海砂写下L的真名前，聪明的L先发制人，将弥海砂作为基拉嫌疑犯关进了Killer对策室，知道同伴被监禁后，月也提出了将自己监禁的要求，但是一切都是在月的计算之中。夜神月为了救弥海砂，想到了一个绝妙的办法--放弃死亡笔记所有权。
同时，因为制作煽动性的跟踪报道“Killer”事件而风头大劲的樱花电视台发生了一连出人意料的事情，主播高田清美追踪Killer的过程中发现了不为人知的秘密，随即第三名Killer出现了。两个死神，两本“死亡笔记”，三个Killer，一切扑朔迷离。死亡笔记的规则被公布于众，两个天才的头脑斗智也在一个一个预想之外的事件中展开。
因为人为的过度开采，工业废料的随意丢弃，导致美丽海岛生态被破坏，变异怪物巨蛇攻击人类。主人公陈朗靠着自己的勇气带领众人逃生并牺牲性命保护家人。通过故事向人们发出了保护生态环境的预警，同时宣扬了团结、守护和爱的人性光辉。
意欲练就不世神功终结乱世的掌门唐元笙指派三徒弟唐欣带领众人秘密夺回秘宝玲珑珠。万无一失的计划却因天女门圣女的出现而失败，唐门惨遭灭门。作为唐门最后的希望，深陷爱恨情仇漩涡的唐垣该何去何从？
在社交网络上伪装女性，用话术诱骗无亲无故的男性套取个人信息，从事户籍买卖的拓也（北村匠海 饰）和守（林裕太 饰），自幼在恶劣环境中长大，不知不觉已成为黑道组织的爪牙。尽管涉足灰色产业，这两个时常插科打诨的年轻人，本质上只是普通的都市青年，彼此相依为命。当拓也在黑道引路人、犹如兄长般存在的梶谷（绫野刚 饰）的协助下，决心与守一同逃离这个黑暗世界时，等待他们的却是......
