古药大陆，万族林立，丹师为尊，阴阳丹神苏北皇为炼神丹耗尽心血却被红颜暗算，与丹药融为一体隐藏百年。百年后，其子孙苏北天受辱，仍顽强抵抗，意外获丹神传承，霸气归来！觉醒冰火双系武脉，重修炼丹神术，成就少年英雄。随着调查母亲失踪的真相，一桩桩阴谋也逐渐浮出水面。且看苏北天历经劫难，勘破武道之极，成就丹道至尊！
在太一一行人告别数码世界后，数码世界并没有就此关闭朝向人类的大门，而数码世界的内部却没有太平多少时日，就又开始了纷争。 数码世界急需一批被选中的孩子来维护数码世界和人类世界的和平。太一、阿和、素娜等人都已先后成为了初中生，没有太多精力和时间能够和数码宝贝们一起并肩作战，只有阿武和小光成为了新一代的领头人。被选中的孩子有本宫大辅（木内玲子 配音）、井之上京（夏树莉绪 配音）、火田伊织（夏树惠 配音）等人，和他们一同战斗的除了亚古兽、加布兽等，还有新的数码宝贝参与。于是，在第一代数码人的带领下，新的数码宝贝和守护者们开始了同邪恶势力的作战……
