在未来世界里，人类研发出了生理上与人类无异的仿生人，二者唯一差别就是可以被植入“初始执念”。由于该产业发展迅猛，有人开始利用其进行非法活动。政府最终出台“仿生人禁止令”。政府成立“明眸搜查部”来配合搜查混迹在人类社会中未被发现的仿生人，调查员程诺（宋威龙饰）和安秋（文淇饰）在组长万国峰（祖峰饰）的带领下展开工作。二人从开始的互看不惯到后来可以默契配合完成案件侦破。就在这个过程中，二人各自隐藏的秘密也渐渐浮出水面。
在第二季的爆炸性事件之后，联调局特工彼得·苏德兰奉命追捕一名年轻的财政部探员——此人杀害上司后携敏感政府情报逃往伊斯坦布尔。由此展开的调查中，彼得一边追查黑钱网络，一边躲避雇佣杀手的追杀，更事与一名执着的记者走向了激烈对峙。两人联手揭开尘封的秘密与旧怨，这些阴谋足以令政府陷入瘫痪，而他们自己也在调查过程中身陷致命危机。
