在第二部里，包拯（陆毅饰）已经褪去了初生牛犊不怕虎的生涩和冲动，而成了稳重有担待的县城父母官，偏安一隅为民请命。这天收到皇上急召回京，查办收受贿赂贪污的官员接连连续死亡的案件。少年包青天再次出动，而沿路上在各个案件里遇见的王朝马汉、张龙赵虎，日后都会是我们熟悉的大名鼎鼎的包公身边的护卫人物。公孙策（任泉饰）已然拜服在包拯的聪明才智下，甘愿辅佐他办案。这次遇见的姑娘的是惯偷小蜻蜓（范冰冰饰），
一心追求自由的女医纪纤云，在权谋的安排下替姐姐出嫁，成为陪葬王妃。为自保，她运用所学医术救了怀孕皇子，又被迫卷入宫廷纷争。面对宫廷纷争，她坦然处之，不慕名利，一碗药膳，圈粉无数，一路奋力自救……
