魅灵侵袭,古神大陆的安宁将如何守护? 本源之力,所得的生命之水遭八方觊觎…… 亲情与道义,安有两全抉择? 被构陷结魔,该如何挣脱囹圄? 林枫能否战胜魔尊分身,重塑魔尊封印,守护古神大陆安宁?
《超级机器人大战·原创世纪》的背景是新西历,人类正式开始进出宇宙2世纪,但因为2次大型陨石的坠下,人们的生活还是维持在21世纪初。到了新西历179年,第3颗陨石“流星3(メテオ3)”坠落于南太平洋的マーケサズ群岛海面。地球连邦政府经过调查,发现是由人类未知的技术制造的物体,这种地球以外的技术被称为EOT(Extra over technology)。地球连邦政府组成了“EOT特别审议会”和“EOTI机关”进行调查。然后EOTI机关的代表比安博士发表了研究结果,表示地球有被宇宙以外的生命体侵略的危机。从此,人型机动兵器:Personal Trooper的研究开始了。