邪电王国的希拉博士因为妒忌人类的超文明,于是向地球进行连串破坏行动。久保田博士下令健太、耕一祈、瞬、千里和杏子变身成电磁战队百万连者,进行对抗邪电的行动。其后,更出现了第六位战士早川裕作,起初新战士不太喜欢电磁战队,后来相处日子越多,感情越深厚。希拉更控制王者魔兽,打算与电磁战队同归于尽。
艾伦为了毁灭世界,发动了「地鸣」。无数的巨人开始进攻,摧毁一切。米卡莎、阿尔敏、让、康尼、汉吉、莱纳、安妮、皮克,以及身受重伤的利威尔……剩下的人们为了阻止艾伦,展开了最后的战斗。