近未来的东京,有着一个为了夺取“最强武器”而建立的两大组织,以开发最强兵器为目的的导示重工,和通过操控遗传因子来制造优秀人类的NSWF。他们的共同目的只有一个,就是得到那个拥有着最强威力、并且只有通过被选中的女人才能操纵的终极武器“WITCHBLADE”。地震灾害的6年之后……天羽雅音、梨穂子 ,两人幸福的生活着,但是,等待着她们的却是,WITCHBLADE那暗之力的召唤,以及异常残酷的命运……
日本各地出现了异空间「魔都」── 由于只有女性能从魔都的「桃」得到特异的能力, 因此便由女兵组成了「魔防队」。 某一天, 过着抑郁生活的男高中生──和仓优希 不小心闯进了突发性产生的魔都入口, 在那里,遇到了「魔防队」第七组的美丽队长──羽前京香, 而她竟向优希宣言:「我要你当我的奴隶。」
随原作漫画第58卷DVD限定版同捆发售。