故事设定在《怪奇物语》的第二季和第三季之间,欢迎回到1985年冬天的霍金斯,主角团将面对新的怪物和超自然之谜。
令和末期,日本因全球核战影响走向衰败,大量难民涌入,更严重的病毒、大地震、苛政与饥荒接连发生,引发民众暴动,国家体制崩溃,人口锐减至原来的十分之一以下,文明水平倒退至明治初期,并分裂为“大和”“武凰”“圣夷”三国。约一百年后,大和历56年,生于爱媛郡的少年三角青辉登上历史舞台,一段以日本再统一为目标的时代故事由此展开。
这个世界里,人类被视为劣等种。冒险者小队「种族会」中负责扛行李的人类少年‧莱特,在世界最凶险的迷宫「奈落」深处遭伙伴放逐,甚至想取他性命。为了在「奈落」活下去,莱特自暴自弃地用了唯一的技能《无限扭蛋》,结果竟召唤出强大无比、「等级9999」的伙伴们──!之后过了三年,莱特自己也升到了等级9999。带着对自己忠心耿耿又怀有好感的美少女们(而且所有人都是等级9999),他以压倒性的力量开始进军地上!!
大山武(前野智昭 配音)即将进入天日学园就读,在这所由女子学校改制而来的综合学校中,由其喜爱女孩子胸部的大山感到如鱼得水。在天日学园里,除了每天要学习的文化课程外,同学们还要学习掌握运用“元素”的技巧,其中格外有天赋者,则能够获得试用“魔具”作为武器的特殊能力。 个性傲娇的青梅竹马天谷春恋(下屋则子 配音),率真坦诚的栉八稻穗(野水伊织 配音),桀骜跋扈的姬神木灵(矢作纱友里 配音),在繁忙又惊险的学习生活中,大山和这些可爱的女孩子们之间产生了坚实的友谊。而随着能力的逐渐提升,大山发现,他们似乎被卷入了一场声势浩大的战争之中。
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」,被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后,恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。