游戏业界是一个与现实相异的世界,存在着四个由女神统治的国家:Planeptune、Lastation、Leanbox和Lowee,四个国家为了争夺女神力量之源“Share”而展开长期战争。但是,因惧怕长期战争导致国力衰弱,女神们最终缔结了禁止武力争夺Share的《友好条约》。就这样,游戏业界迈向崭新的未来,四个国家的女神和候补生妹妹也开始了新的生活——。
从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」,被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后,恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。