故事从大学生四叶枫开始展开，他是一个完全没有恋爱经验的人，却被校内人人憧憬的学长鸿上沙罗告知“自己是来自平行世界的存在，并且他们在那个世界中是恋人关系”。随着情节的发展，二人面对各自隐藏的秘密和内心的挣扎，逐渐揭示他们对爱情的选择。
正魔争斗千年。正道领袖风月剑尊、魔教星主凤行天生死决战。两人的后辈沈少游、凤离雪却因机缘巧合结成好友。为保护师父，沈少游失手将离雪推下悬崖。离雪被魔教第一高手重华救起带走。两人的命运从此改写。离雪将成为魔教教主。而沈少游却将成为正道的盟主，注定了要相遇相杀。十年后，两人重逢。离雪利用少游的愧疚潜伏在他身边，几次刺杀。却最终被少游的宽容、善良打动，情愫暗生。就在离雪决定放下父仇，改恶向善时，重华强加干涉，设计让两人彼此误会、仇恨。最终，离雪成为教主，与盟主沈少游决战。历经磨难后，两人感受到彼此的真心，最终再度携手。无论出身正邪，无论成长于仙境魔域，只有一件事始终不变：心中的正义与爱。
《铁齿铜牙纪晓岚3》由“好女争锋”、“假作真来真亦假”、“江湖江湖”、“辨奸计”和“胭脂红”五个单元故事组成。故事由神秘的江南女子陆琳琅（张庭饰）的出现而变得一波不平一波又起。陆姑娘深受乾隆（张铁林饰）宠爱，暂住纪晓岚（张国立饰）府上。然而和珅（王刚饰）早知陆姑娘身世， 为斩草除根，多番设计陷害陆姑娘。幸得纪晓岚解救，并一洗陆家冤情。然而这三个老男人却都陷入了儿女情长的重重矛盾中，本不平静的京城更是风波不断。 由“铁三角”张铁林、张国立、王刚主演的系列电视剧《铁齿铜牙纪晓岚》，至2009年已发行四部。作为该系列电视剧的第三部，本剧集不仅由这三位老戏骨继续联袂演绎，更在人物关系的设定上，邀请台湾笑星张庭出演神秘女子陆琳琅，为本剧增色不少。
