故事设定在《废头》世界的1042年前,以机器人“罗宾”作为主角。罗宾原本作为护卫,随同调查队长特里斯前往地下世界调查异常情况。尽管肩负保护特里斯的使命,但调查队却遭到了人工生命体马里甘的邪教组织“吉拉教”的袭击。在压倒性的战力差距下,调查队陷入苦战。然而,在这场激烈的交锋中,他们发现了次元的扭曲,并逐步揭开地下世界隐藏的秘密与异变的真相。
魔法が技術として確立され、約一世紀が過ぎた二〇九五年四月。rn魔法師を育成する国立魔法大学付属第一高校、通称“魔法科高校”に二人の兄妹が入学した。rn一人は魔法師として致命的な欠陥を抱える劣等生の兄・達也。rnもう一人は完全無欠の魔法師として讃えられる優等生の妹・深雪。rn時に恋人同士と間違われるほど仲睦まじい二人だが、ほんの数年前までは、まるで女主人と使用人のように冷え切った関係だった。rnその関係が変わった背景には、ある出来事があった。rn三年前の沖縄。rn深雪にとって忘れられない出来事によって、二人の心と、その運命が大きく変わっていく。rnシリーズ累計2000万部を突破したスクールマギクスの始まりの物語《追憶編》が幕を開ける。