故事紧接着上一季，通过一场精心策划的大爆炸，沃尔特（布莱恩·科兰斯顿 Bryan Cranston 饰）终于除掉了长久以来的威胁古斯塔沃（吉安卡洛·埃斯珀西多 Giancarlo Esposito 饰），也将古斯塔沃一手建立的毒品帝国连根拔起。然而，“事业”上的成功并没有为沃尔特带来太多的快乐，因为他和妻子斯凯勒（安娜·古恩 Anna Gunn 饰）之间的关系再次跌落到了冰点。 古斯塔沃死了，但沃尔特的野心并没有消失，他联手杰西（亚伦·保尔 Aaron Paul 饰）与麦克（乔纳森·班克斯 Jonathan Banks 饰），开始建立属于他的新的帝国。一次偶然中，汉克（迪恩·诺里斯 Dean Norris 饰）在沃尔特家中发现了沃尔特就是海森堡的确凿证据，巨大的打击之下，他决心大义灭亲，昔日的连襟，如今沦为对手。与此同时，一股新的势力正在毒品圈内逐渐壮大，他们即将成为汉克最强大的敌人。
魔法师马雷（马文忠 饰）想要搅乱时光轮盘的运转，毁灭地球，却在千钧一发之际受到了一位神秘时光卫士的阻挠，尽管马雷的阴谋暂时没有得逞，但地球依旧运转在危机的阴影之下。 为了保卫世界的和平，傻妞（舒畅 饰）找到了男孩陆冬雨（曹骏 饰），将他带回现代，只有他才能够阻止马雷的阴谋，而巧合的是，陆冬雨一直在寻找的母亲正是那名神秘的时光卫士。谁知道马雷知晓了傻妞的计划，偷偷尾随，想要借他们两人之手找到时光卫士将其杀死，与此同时，陆冬雨的父亲陆小千（李滨 饰）亦被卷入了这场纷争之中，他必须在时限之内恢复傻妞被破坏的系统，才能真正阻止马雷的阴谋。
唐末僖宗年间，中国四分五裂，群雄并起，其中以李克用（秦沛）及朱温（刘兆铭）势力最大，个据一方，互相抗衡。 李为人功于心计，立心灭朱统一天下。李利用女儿云罗公主（陈玉莲）之美貌纠集属下十三名来自各派的武林高手。 此十三名高手能征惯战，江湖中人称之为十三太保。十三太保中以李存孝（黄日华）武功最高，为用之得利杀手，亦最为云所爱。 但孝淡薄权势，他之所以纳入用门下，目的只为杀温为父报仇。但另一方面，十三太保之一的康君利（汤镇业），为人供于心计，为得用之宠爱，处处设计陷害孝。 李克用在十三太保帮助下，本可处极好优势，但在内忧外患下，能否灭朱而统天下呢？而孝又是否能为父报仇呢？
